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    Genomic and immunogenomic analysis of three prognostic signature genes in LUAD.
    Feng, Hai-Ming ; Zhao, Ye ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 24 (2023-01-17), Heft 1, S. 1-31
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    dgfr: an R package to assess sequence diversity of gene families.
    Almeida, Laila Viana ; Reis-Cunha, João Luís ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-06), Heft 1, S. 1-6
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    RNA-clique: a method for computing genetic distances from RNA-seq data.
    Tapia, Andrew C. ; Jaromczyk, Jerzy W. ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-04), Heft 1, S. 1-33
    Online academicJournal
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    Biclustering analysis on tree-shaped time-series single cell gene expression data of Caenorhabditis elegans.
    Guan, Qi ; Yan, Xianzhong ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-05-09), Heft 1, S. 1-15
    Online academicJournal
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    A comparison of RNA-Seq data preprocessing pipelines for transcriptomic predictions across independent studies.
    Van, Richard ; Alvarez, Daniel ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-05-08), Heft 1, S. 1-22
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    Predictive modeling of gene expression regulation.
    Regondi, Chiara ; Fratelli, Maddalena ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 22 (2021-11-27), Heft 1, S. 1-21
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    Inference of genomic landscapes using ordered Hidden Markov Models with emission densities (oHMMed).
    Vogl, Claus ; Karapetiants, Mariia ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-04-16), Heft 1, S. 1-24
    Online academicJournal
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    Control of false discoveries in grouped hypothesis testing for eQTL data.
    Rudra, Pratyaydipta ; Zhou, Yi-Hui ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-04-11), Heft 1, S. 1-14
    Online academicJournal
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    SurvConvMixer: robust and interpretable cancer survival prediction based on ConvMixer using pathway-level gene expression images.
    Wang, Shuo ; Liu, Yuanning ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-27), Heft 1, S. 1-20
    Online academicJournal
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    Feature-specific quantile normalization and feature-specific mean–variance normalization deliver robust bi-directional classification and feature selection performance between microarray and RNAseq data.
    Skubleny, Daniel ; Ghosh, Sunita ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-29), Heft 1, S. 1-14
    Online academicJournal
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    Curare and GenExVis: a versatile toolkit for analyzing and visualizing RNA-Seq data.
    Blumenkamp, Patrick ; Pfister, Max ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-29), Heft 1, S. 1-12
    Online academicJournal
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    Machine learning on alignment features for parent-of-origin classification of simulated hybrid RNA-seq.
    Miller, Jason R. ; Adjeroh, Donald A.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-12), Heft 1, S. 1-21
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    Gbdmr: identifying differentially methylated CpG regions in the human genome via generalized beta regressions.
    Wu, Chengzhou ; Mou, Xichen ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-05), Heft 1, S. 1-17
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    A clustering procedure for three-way RNA sequencing data using data transformations and matrix-variate Gaussian mixture models.
    Scharl, Theresa ; Grün, Bettina
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-01), Heft 1, S. 1-21
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    AStruct: detection of allele-specific RNA secondary structure in structuromic probing data.
    Xu, Qingru ; Bao, Xiaoqiong ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-01), Heft 1, S. 1-11
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    Few-shot genes selection: subset of PAM50 genes for breast cancer subtypes classification.
    Okimoto, Leandro Y. S. ; Mendonca-Neto, Rayol ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-01), Heft 1, S. 1-22
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    Enabling personalised disease diagnosis by combining a patient's time-specific gene expression profile with a biomedical knowledge base.
    Verma, Ghanshyam ; Rebholz-Schuhmann, Dietrich ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-02-07), Heft 1, S. 1-26
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    Comparing de novo transcriptome assembly tools in di- and autotetraploid non-model plant species.
    Madritsch, Silvia ; Burg, Agnes ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 22 (2021-03-22), Heft 1, S. 1-17
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    InClust+: the deep generative framework with mask modules for multimodal data integration, imputation, and cross-modal generation.
    Wang, Lifei ; Nie, Rui ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-01-24), Heft 1, S. 1-17
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    Cellograph: a semi-supervised approach to analyzing multi-condition single-cell RNA-sequencing data using graph neural networks.
    Shahir, Jamshaid A. ; Stanley, Natalie ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-01-15), Heft 1, S. 1-19
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