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    Finding haplotypic signatures in proteins.
    Vašíček, Jakub ; Skiadopoulou, Dafni ; et al.
    In: GigaScience, Jg. 12 (2023), Heft 1, S. 1-13
    Online academicJournal
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    Protein intrinsically disordered regions have a non-random, modular architecture.
    McConnell, Brendan S ; Parker, Matthew W
    In: Bioinformatics, Jg. 39 (2023-12-01), Heft 12, S. 1-8
    Online academicJournal
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    SHEPHARD: a modular and extensible software architecture for analyzing and annotating large protein datasets.
    Ginell, Garrett M ; Flynn, Aidan J ; et al.
    In: Bioinformatics, Jg. 39 (2023-08-01), Heft 8, S. 1-5
    Online academicJournal
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    LEGO-CSM: a tool for functional characterization of proteins.
    Nguyen, Thanh Binh ; Sá, Alex G C de ; et al.
    In: Bioinformatics, Jg. 39 (2023-07-01), Heft 7, S. 1-4
    Online academicJournal
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    A Machine Learning Framework Identifies Plastid-Encoded Proteins Harboring C<subscript>3</subscript> and C<subscript>4</subscript> Distinguishing Sequence Information.
    Yogadasan, Nilanth ; Doxey, Andrew C ; et al.
    In: Genome Biology & Evolution, Jg. 15 (2023-07-01), Heft 7, S. 1-17
    Online academicJournal
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    Highly Abundant Proteins Are Highly Thermostable.
    Luzuriaga-Neira, Agusto R ; Ritchie, Andrew M ; et al.
    In: Genome Biology & Evolution, Jg. 15 (2023-07-01), Heft 7, S. 1-10
    Online academicJournal
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    Unsupervised Deep Learning Can Identify Protein Functional Groups from Unaligned Sequences.
    David, Kyle T ; Halanych, Kenneth M
    In: Genome Biology & Evolution, Jg. 15 (2023-05-01), Heft 5, S. 1-10
    Online academicJournal
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    The Missing Expression Level–Evolutionary Rate Anticorrelation in Viruses Does Not Support Protein Function as a Main Constraint on Sequence Evolution.
    Wei, Changshuo ; Chen, Yan-Ming ; et al.
    In: Genome Biology & Evolution, Jg. 13 (2021-04-01), Heft 4, S. 1-18
    Online academicJournal
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    Enhanced compound-protein binding affinity prediction by representing protein multimodal information via a coevolutionary strategy.
    Guo, Binjie ; Zheng, Hanyu ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-03-01), Heft 2, S. 1-15
    Online academicJournal
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    Guide tree optimization with genetic algorithm to improve multiple protein 3D-structure alignment.
    Shegay, Maksim V ; Švedas, Vytas K ; et al.
    In: Bioinformatics, Jg. 38 (2022-02-15), Heft 4, S. 985-989
    Online academicJournal
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    learnMSA: learning and aligning large protein families.
    Becker, Felix ; Stanke, Mario
    In: GigaScience, Jg. 11 (2022), S. 1-14
    Online academicJournal
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    Leveraging genomic redundancy to improve inference and alignment of orthologous proteins.
    Singleton, Marc ; Eisen, Michael
    In: G3: Genes | Genomes | Genetics, Jg. 13 (2023-12-01), Heft 12, S. 1-15
    Online academicJournal
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    PreHom-PCLM: protein remote homology detection by combing motifs and protein cubic language model.
    Shao, Jiangyi ; Zhang, Qi ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-11-01), Heft 6, S. 1-10
    academicJournal
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    HNetGO: protein function prediction via heterogeneous network transformer.
    Zhang, Xiaoshuai ; Guo, Huannan ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-11-01), Heft 6, S. 1-10
    academicJournal
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    Protein functional annotation of simultaneously improved stability, accuracy and false discovery rate achieved by a sequence-based deep learning.
    Hong, Jiajun ; Luo, Yongchao ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 21 (2020-07-01), Heft 4, S. 1437-1447
    Online academicJournal
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  16. Detailansicht für Treffer 16 öffnen
    An Overexpression Experiment Does Not Support the Hypothesis That Avoidance of Toxicity Determines the Rate of Protein Evolution.
    Biesiadecka, Magdalena K ; Sliwa, Piotr ; et al.
    In: Genome Biology & Evolution, Jg. 12 (2020-05-01), Heft 5, S. 589-596
    Online academicJournal
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    Photoactive yellow protein and its chemical probes: an approach to protein labelling in living cells.
    Kumar, Naresh ; Hori, Yuichiro ; et al.
    In: Journal of Biochemistry, Jg. 166 (2019-08-01), Heft 2, S. 121-127
    academicJournal
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    HiFun: homology independent protein function prediction by a novel protein-language self-attention model.
    Wu, Jun ; Qing, Haipeng ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-09-01), Heft 5, S. 1-12
    academicJournal
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    Shared unfolding pathways of unrelated immunoglobulin-like β-sandwich proteins.
    Toofanny, Rudesh D ; Calhoun, Sara ; et al.
    In: PEDS: Protein Engineering, Design & Selection, Jg. 32 (2019-07-01), Heft 7, S. 331-345
    Online academicJournal
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    GPCR-GIA: a web-server for identifying G-protein coupled receptors and their families with grey incidence analysis.
    Lin, Wei-Zhong ; Xiao, Xuan ; et al.
    In: PEDS: Protein Engineering, Design & Selection, Jg. 22 (2009-11-01), Heft 11, S. 699-705
    Online academicJournal
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