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    GAMBIT (Genomic Approximation Method for Bacterial Identification and Tracking): A methodology to rapidly leverage whole genome sequencing of bacterial isolates for clinical identification.
    Lumpe, J ; Gumbleton, L ; et al.
    In: PloS one, Jg. 18 (2023-02-16), Heft 2, S. e0277575
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    Comparative genomics of DNA-binding transcription factors in archaeal and bacterial organisms.
    Martinez-Liu, L ; Hernandez-Guerrero, R ; et al.
    In: PloS one, Jg. 16 (2021-07-02), Heft 7, S. e0254025
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    CODON-Software to manual curation of prokaryotic genomes.
    Merlin, B ; Castro Alves, JT ; et al.
    In: PLoS computational biology, Jg. 17 (2021-03-31), Heft 3, S. e1008797
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    Forensic genetics and genomics: Much more than just a human affair.
    Arenas, M ; Pereira, F ; et al.
    In: PLoS genetics, Jg. 13 (2017-09-21), Heft 9, S. e1006960
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    A New Comparative-Genomics Approach for Defining Phenotype-Specific Indicators Reveals Specific Genetic Markers in Predatory Bacteria.
    Pasternak, Z ; Ben Sasson, T ; et al.
    In: PloS one, Jg. 10 (2015-11-16), Heft 11, S. e0142933
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    A k-mer-based method for the identification of phenotype-associated genomic biomarkers and predicting phenotypes of sequenced bacteria.
    Aun, E ; Brauer, A ; et al.
    In: PLoS computational biology, Jg. 14 (2018-10-22), Heft 10, S. e1006434
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    GABenchToB: a genome assembly benchmark tuned on bacteria and benchtop sequencers.
    Jünemann, S ; Prior, K ; et al.
    In: PloS one, Jg. 9 (2014-09-08), Heft 9, S. e107014
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    MediaDB: a database of microbial growth conditions in defined media.
    Richards, MA ; Cassen, V ; et al.
    In: PloS one, Jg. 9 (2014-08-06), Heft 8, S. e103548
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    A novel nutritional predictor links microbial fastidiousness with lowered ubiquity, growth rate, and cooperativeness.
    Zarecki, R ; Oberhardt, MA ; et al.
    In: PLoS computational biology, Jg. 10 (2014-07-17), Heft 7, S. e1003726
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    The first complete genome sequence of the class Fimbriimonadia in the phylum Armatimonadetes.
    Hu, ZY ; Wang, YZ ; et al.
    In: PloS one, Jg. 9 (2014-06-26), Heft 6, S. e100794
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    The candidate phylum Poribacteria by single-cell genomics: new insights into phylogeny, cell-compartmentation, eukaryote-like repeat proteins, and other genomic features.
    Kamke, J ; Rinke, C ; et al.
    In: PloS one, Jg. 9 (2014-01-31), Heft 1, S. e87353
    Online academicJournal
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    Low-bandwidth and non-compute intensive remote identification of microbes from raw sequencing reads.
    Gautier, L ; Lund, O
    In: PloS one, Jg. 8 (2013-12-31), Heft 12, S. e83784
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    Tracing evolutionary footprints to identify novel gene functional linkages.
    Chen, Y ; Yang, L ; et al.
    In: PloS one, Jg. 8 (2013-06-25), Heft 6, S. e66817
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    Insights from genomics into bacterial pathogen populations.
    Wilson, DJ
    In: PLoS pathogens, Jg. 8 (2012-09-01), Heft 9, S. e1002874
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    One bacterial cell, one complete genome.
    Woyke, T ; Tighe, D ; et al.
    In: PloS one, Jg. 5 (2010-04-23), Heft 4, S. e10314
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    Toward the use of genomics to study microevolutionary change in bacteria.
    Falush, D
    In: PLoS genetics, Jg. 5 (2009-10-01), Heft 10, S. e1000627
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    Dissimilatory metabolism of nitrogen oxides in bacteria: comparative reconstruction of transcriptional networks.
    Rodionov, DA ; Dubchak, IL ; et al.
    In: PLoS computational biology, Jg. 1 (2005-10-01), Heft 5, S. e55
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    3-way networks: application of hypergraphs for modelling increased complexity in comparative genomics.
    Weighill, DA ; Jacobson, DA
    In: PLoS computational biology, Jg. 11 (2015-03-27), Heft 3, S. e1004079
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    Response of Bacteria Community to Long-Term Inorganic Nitrogen Application in Mulberry Field Soil.
    Yu, Cui ; Hu, Xingming ; et al.
    In: PLoS ONE, Jg. 11 (2016-12-15), Heft 12, S. 1-12
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    Single Nucleotide Polymorphisms in IL17A and IL6 Are Associated with Decreased Risk for Pulmonary Tuberculosis in Southern Brazilian Population.
    Milano, Mariana ; Moraes, Milton Ozório ; et al.
    In: PLoS ONE, Jg. 11 (2016-02-03), Heft 2, S. 1-11
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