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    Effect of tokenization on transformers for biological sequences.
    Dotan, E ; Jaschek, G ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 40 (2024-03-29), Heft 4
    Online academicJournal
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    DeepSS2GO: protein function prediction from secondary structure.
    Song, FV ; Su, J ; et al.
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-27), Heft 3
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    Scoring alignments by embedding vector similarity.
    Ashrafzadeh, S ; Golding, GB ; et al.
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-27), Heft 3
    academicJournal
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    IRSOM2: a web server for predicting bifunctional RNAs.
    Postic, G ; Tav, C ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 51 (2023-07-05), Heft W1, S. W281-W288
    Online academicJournal
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    A unified approach to protein domain parsing with inter-residue distance matrix.
    Zhu, K ; Su, H ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023-02-03), Heft 2
    Online academicJournal
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    Integration of single cell data by disentangled representation learning.
    Guo, T ; Chen, Y ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 50 (2022-01-25), Heft 2, S. e8
    Online academicJournal
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    An approach to gene-based testing accounting for dependence of tests among nearby genes.
    Yurko, R ; Roeder, K ; et al.
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 22 (2021-11-05), Heft 6
    Online academicJournal
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    Consensus clustering of single-cell RNA-seq data by enhancing network affinity.
    Cui, Y ; Zhang, S ; et al.
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 22 (2021-11-05), Heft 6
    Online academicJournal
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    Accurate assembly of minority viral haplotypes from next-generation sequencing through efficient noise reduction.
    Knyazev, S ; Tsyvina, V ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 49 (2021-09-27), Heft 17, S. e102
    Online academicJournal
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    Multi-resolution characterization of molecular taxonomies in bulk and single-cell transcriptomics data.
    Reed, ER ; Monti, S
    In: Nucleic acids research, Jg. 49 (2021-09-27), Heft 17, S. e98
    Online academicJournal
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  11. Detailansicht für Treffer 11 öffnen
    A sensitive repeat identification framework based on short and long reads.
    Liao, X ; Li, M ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 49 (2021-09-27), Heft 17, S. e100
    Online academicJournal
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  12. Detailansicht für Treffer 12 öffnen
    Leveraging three-dimensional chromatin architecture for effective reconstruction of enhancer-target gene regulatory interactions.
    Salviato, E ; Djordjilović, V ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 49 (2021-09-27), Heft 17, S. e97
    Online academicJournal
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  13. Detailansicht für Treffer 13 öffnen
    Rank-in: enabling integrative analysis across microarray and RNA-seq for cancer.
    Tang, K ; Ji, X ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 49 (2021-09-27), Heft 17, S. e99
    Online academicJournal
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  14. Detailansicht für Treffer 14 öffnen
    SAResNet: self-attention residual network for predicting DNA-protein binding.
    Shen, LC ; Liu, Y ; et al.
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 22 (2021-09-02), Heft 5
    Online academicJournal
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  15. Detailansicht für Treffer 15 öffnen
    Deep learning of gene relationships from single cell time-course expression data.
    Yuan, Y ; Bar-Joseph, Z
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 22 (2021-09-02), Heft 5
    Online academicJournal
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    ngsComposer: an automated pipeline for empirically based NGS data quality filtering.
    Kuster, RD ; Yencho, GC ; et al.
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 22 (2021-09-02), Heft 5
    Online academicJournal
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    ANANSE: an enhancer network-based computational approach for predicting key transcription factors in cell fate determination.
    Xu, Q ; Georgiou, G ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 49 (2021-08-20), Heft 14, S. 7966-7985
    Online academicJournal
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  18. Detailansicht für Treffer 18 öffnen
    FisherMP: fully parallel algorithm for detecting combinatorial motifs from large ChIP-seq datasets.
    Zhang, S ; Liang, Y ; et al.
    In: DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes, Jg. 26 (2019-06-01), Heft 3, S. 231-242
    Online academicJournal
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  19. Detailansicht für Treffer 19 öffnen
    GP4: an integrated Gram-Positive Protein Prediction Pipeline for subcellular localization mimicking bacterial sorting.
    Grasso, S ; van Rij T ; et al.
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 22 (2021-07-20), Heft 4
    Online academicJournal
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    Pretraining model for biological sequence data.
    Song, B ; Li, Z ; et al.
    In: Briefings in functional genomics, Jg. 20 (2021-06-09), Heft 3, S. 181-195
    Online academicJournal
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