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    A comparison of RNA-Seq data preprocessing pipelines for transcriptomic predictions across independent studies.
    Van, Richard ; Alvarez, Daniel ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-05-08), Heft 1, S. 1-22
    Online academicJournal
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    Feature-specific quantile normalization and feature-specific mean–variance normalization deliver robust bi-directional classification and feature selection performance between microarray and RNAseq data.
    Skubleny, Daniel ; Ghosh, Sunita ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-29), Heft 1, S. 1-14
    Online academicJournal
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    Machine learning on alignment features for parent-of-origin classification of simulated hybrid RNA-seq.
    Miller, Jason R. ; Adjeroh, Donald A.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-12), Heft 1, S. 1-21
    Online academicJournal
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    Enabling personalised disease diagnosis by combining a patient's time-specific gene expression profile with a biomedical knowledge base.
    Verma, Ghanshyam ; Rebholz-Schuhmann, Dietrich ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-02-07), Heft 1, S. 1-26
    Online academicJournal
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    MHESMMR: a multilevel model for predicting the regulation of miRNAs expression by small molecules.
    Guan, Yong-Jian ; Yu, Chang-Qing ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-01-02), Heft 1, S. 1-20
    Online academicJournal
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    GCNFORMER: graph convolutional network and transformer for predicting lncRNA-disease associations.
    Yao, Dengju ; Li, Bailin ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-01-02), Heft 1, S. 1-19
    Online academicJournal
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    A novel and innovative cancer classification framework through a consecutive utilization of hybrid feature selection.
    Mahto, Rajul ; Ahmed, Saboor Uddin ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 24 (2023-12-15), Heft 1, S. 1-26
    Online academicJournal
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    Hierarchical classification-based pan-cancer methylation analysis to classify primary cancer.
    Yang, Youpeng ; Zeng, Qiuhong ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 24 (2023-12-08), Heft 1, S. 1-14
    Online academicJournal
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    Predictive modeling of gene expression regulation.
    Regondi, Chiara ; Fratelli, Maddalena ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 22 (2021-11-27), Heft 1, S. 1-21
    Online academicJournal
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    Prediction and prioritization of autism-associated long non-coding RNAs using gene expression and sequence features.
    Wang, Jun ; Wang, Liangjiang
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 21 (2020-11-07), Heft 1, S. 1-15
    Online academicJournal
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    Mirnacle: machine learning with SMOTE and random forest for improving selectivity in pre-miRNA ab initio prediction.
    Marques, Yuri Bento ; de Paiva Oliveira, Alcione ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 17 (2016-12-14), S. 53-63
    Online academicJournal
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    Modeling transcriptional regulation using gene regulatory networks based on multi-omics data sources.
    Patel, Neel ; Bush, William S.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 22 (2021-04-19), Heft 1, S. 1-19
    Online academicJournal
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    Juxtapose: a gene-embedding approach for comparing co-expression networks.
    Ovens, Katie ; Maleki, Farhad ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 22 (2021-03-16), Heft 1, S. 1-26
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    Predicting chemosensitivity using drug perturbed gene dynamics.
    Mannheimer, Joshua D. ; Prasad, Ashok ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 22 (2021-01-07), Heft 1, S. 1-18
    Online academicJournal
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    Direct comparison shows that mRNA-based diagnostics incorporate information which cannot be learned directly from genomic mutations.
    Ravkin, Hersh D. ; Givton, Ofer ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 21 (2020-05-19), Heft 1, S. 1-10
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    ForestSubtype: a cancer subtype identifying approach based on high-dimensional genomic data and a parallel random forest.
    Luo, Junwei ; Feng, Yading ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 24 (2023-07-19), Heft 1, S. 1-19
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    DeeP4med: deep learning for P4 medicine to predict normal and cancer transcriptome in multiple human tissues.
    Mahdi-Esferizi, Roohallah ; Haji Molla Hoseyni, Behnaz ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 24 (2023-07-04), Heft 1, S. 1-22
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    Comparative evaluation of set-level techniques in predictive classification of gene expression samples.
    Holec, Matej ; Kléma, Jirí ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 13 (2012-01-11), Heft Suppl 10, S. 1-15
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    MaGIC: a machine learning tool set and web application for monoallelic gene inference from chromatin.
    Vinogradova, Svetlana ; Saksena, Sachit D. ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 20 (2019-02-28), Heft 1, S. 1-5
    Online academicJournal
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    Candidate gene prioritization by network analysisof differential expression using machine learningapproaches.
    Nitsch, Daniela ; Gonçalves, Joana P. ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 11 (2010), S. 460-475
    Online academicJournal
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