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    AMDBNorm: an approach based on distribution adjustment to eliminate batch effects of gene expression data.
    Zhang, X ; Ye, Z ; et al.
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 23 (2022-01-17), Heft 1
    Online academicJournal
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    Accurate and interpretable gene expression imputation on scRNA-seq data using IGSimpute.
    Xu, Ke ; Cheong, Chin ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-05-01), Heft 3, S. 1-12
    Online academicJournal
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    Personalized immune subtypes based on machine learning predict response to checkpoint blockade in gastric cancer.
    Huang, Weibin ; Zhang, Yuhui ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023), Heft 1, S. 1-10
    Online academicJournal
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    STEEL enables high-resolution delineation of spatiotemporal transcriptomic data.
    Chen, Yamao ; Zhou, Shengyu ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-03-01), Heft 2, S. 1-10
    Online academicJournal
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    Spatial transcriptomics prediction from histology jointly through Transformer and graph neural networks.
    Zeng, Yuansong ; Wei, Zhuoyi ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 23 (2022-09-01), Heft 5, S. 1-12
    Online academicJournal
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    SEGCECO: Subgraph Embedding of Gene expression matrix for prediction of CEll-cell COmmunication.
    Vasighizaker, Akram ; Hora, Sheena ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 25 (2024-05-01), Heft 3, S. 1-9
    academicJournal
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    DeepFGRN: inference of gene regulatory network with regulation type based on directed graph embedding.
    Gao, Zhen ; Su, Yansen ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 25 (2024-05-01), Heft 3, S. 1-13
    academicJournal
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    High-throughput single-cell RNA-seq data imputation and characterization with surrogate-assisted automated deep learning.
    Li, Xiangtao ; Li, Shaochuan ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 23 (2022), Heft 1, S. 1-21
    Online academicJournal
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    ADEIP: an integrated platform of age-dependent expression and immune profiles across human tissues.
    Liu, Xuan ; Chen, Wenbo ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 22 (2021-11-01), Heft 6, S. 1-8
    Online academicJournal
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    new thinking: extended application of genomic selection to screen multiomics data for development of novel hypoxia-immune biomarkers and target therapy of clear cell renal cell carcinoma.
    Gui, Cheng-Peng ; Wei, Jin-Huan ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 22 (2021-11-01), Heft 6, S. 1-21
    Online academicJournal
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  11. Detailansicht für Treffer 11 öffnen
    Exploring miRNA–target gene pair detection in disease with coRmiT.
    Cordoba-Caballero, Jose ; Perkins, James R ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-01), Heft 2, S. 1-13
    academicJournal
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    SGCAST: symmetric graph convolutional auto-encoder for scalable and accurate study of spatial transcriptomics.
    Li, Jinzhao ; Wang, Jiong ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 25 (2024), Heft 1, S. 1-10
    academicJournal
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    ICBcomb: a comprehensive expression database for immune checkpoint blockade combination therapy.
    Xia, Yun ; Gao, Yan ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 25 (2024), Heft 1, S. 1-10
    academicJournal
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    NG-SEM: an effective non-Gaussian structural equation modeling framework for gene regulatory network inference from single-cell RNA-seq data.
    Zhao, Jiaying ; Wong, Chi-Wing ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-11-01), Heft 6, S. 1-10
    academicJournal
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    SCDC: bulk gene expression deconvolution by multiple single-cell RNA sequencing references.
    Dong, Meichen ; Thennavan, Aatish ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 22 (2021), Heft 1, S. 416-427
    Online academicJournal
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  16. Detailansicht für Treffer 16 öffnen
    Differential variability analysis of single-cell gene expression data.
    Liu, Jiayi ; Kreimer, Anat ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-09-01), Heft 5, S. 1-13
    academicJournal
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  17. Detailansicht für Treffer 17 öffnen
    Identifying spatial domains of spatially resolved transcriptomics via multi-view graph convolutional networks.
    Shi, Xuejing ; Zhu, Juntong ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-09-01), Heft 5, S. 1-14
    academicJournal
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  18. Detailansicht für Treffer 18 öffnen
    Spatial-MGCN: a novel multi-view graph convolutional network for identifying spatial domains with attention mechanism.
    Wang, Bo ; Luo, Jiawei ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-09-01), Heft 5, S. 1-11
    academicJournal
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  19. Detailansicht für Treffer 19 öffnen
    hppRNA—a Snakemake-based handy parameter-free pipeline for RNA-Seq analysis of numerous samples.
    Wang, Dapeng
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 19 (2018-07-01), Heft 4, S. 622-626
    Online academicJournal
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    Identification of significant gene expression changes in multiple perturbation experiments using knockoffs.
    Zhao, Tingting ; Zhu, Guangyu ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-03-01), Heft 2, S. 1-13
    Online academicJournal
    Zugriff:
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