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88 Treffer

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    LogicGep: Boolean networks inference using symbolic regression from time-series transcriptomic profiling data.
    Zhang, D ; Gao, S ; et al.
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 25 (2024-05-23), Heft 4
    academicJournal
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    Topological benchmarking of algorithms to infer gene regulatory networks from single-cell RNA-seq data.
    Stock, M ; Popp, N ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 40 (2024-05-02), Heft 5
    Online academicJournal
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    Wie komme ich dran?
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    Individualized causal discovery with latent trajectory embedded Bayesian networks.
    Zhou, F ; He, K ; et al.
    In: Biometrics, Jg. 79 (2023-12-01), Heft 4, S. 3191-3202
    Online academicJournal
    Zugriff:
    Full Text Finder (Volltext)
    Wie komme ich dran?
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    iLSGRN: inference of large-scale gene regulatory networks based on multi-model fusion.
    Wu, Y ; Qian, B ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023-10-03), Heft 10
    Online academicJournal
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    Robust discovery of gene regulatory networks from single-cell gene expression data by Causal Inference Using Composition of Transactions.
    Shojaee, A ; Huang, SC
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 24 (2023-09-22), Heft 6
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    Prior knowledge-guided multilevel graph neural network for tumor risk prediction and interpretation via multi-omics data integration.
    Yan, H ; Weng, D ; et al.
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-27), Heft 3
    academicJournal
    Wie komme ich dran?
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    LogBTF: gene regulatory network inference using Boolean threshold network model from single-cell gene expression data.
    Li, L ; Sun, L ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023-05-04), Heft 5
    Online academicJournal
    Zugriff:
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    Wie komme ich dran?
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    Fast and accurate inference of gene regulatory networks through robust precision matrix estimation.
    Passemiers, A ; Moreau, Y ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 38 (2022-05-13), Heft 10, S. 2802-2809
    Online academicJournal
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  9. Detailansicht für Treffer 9 öffnen
    Boolean network sketches: a unifying framework for logical model inference.
    Beneš, N ; Brim, L ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023-04-03), Heft 4
    Online academicJournal
    Zugriff:
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  10. Detailansicht für Treffer 10 öffnen
    HumanNet v3: an improved database of human gene networks for disease research.
    Kim, CY ; Baek, S ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 50 (2022-01-07), Heft D1, S. D632-D639
    Online academicJournal
    Zugriff:
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  11. Detailansicht für Treffer 11 öffnen
    ANANSE: an enhancer network-based computational approach for predicting key transcription factors in cell fate determination.
    Xu, Q ; Georgiou, G ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 49 (2021-08-20), Heft 14, S. 7966-7985
    Online academicJournal
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  12. Detailansicht für Treffer 12 öffnen
    A practical guide to mechanistic systems modeling in biology using a logic-based approach.
    Niarakis, A ; Helikar, T
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 22 (2021-07-20), Heft 4
    Online academicJournal
    Zugriff:
    Full Text Finder (Volltext)
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  13. Detailansicht für Treffer 13 öffnen
    A novel constrained genetic algorithm-based Boolean network inference method from steady-state gene expression data.
    Trinh, HC ; Kwon, YK
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 37 (2021-07-12), Heft Suppl_1, S. i383-i391
    Online academicJournal
    Zugriff:
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    TENET: gene network reconstruction using transfer entropy reveals key regulatory factors from single cell transcriptomic data.
    Kim, J ; T Jakobsen, S ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 49 (2021-01-11), Heft 1, S. e1
    Online academicJournal
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  15. Detailansicht für Treffer 15 öffnen
    Non-homogeneous dynamic Bayesian networks with edge-wise sequentially coupled parameters.
    Shafiee Kamalabad, M ; Grzegorczyk, M
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 36 (2020-02-15), Heft 4, S. 1198-1207
    Online academicJournal
    Zugriff:
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  16. Detailansicht für Treffer 16 öffnen
    Inference of differential gene regulatory networks based on gene expression and genetic perturbation data.
    Zhou, X ; Cai, X
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 36 (2020), Heft 1, S. 197-204
    Online academicJournal
    Zugriff:
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  17. Detailansicht für Treffer 17 öffnen
    Network inference performance complexity: a consequence of topological, experimental and algorithmic determinants.
    Muldoon, JJ ; Yu, JS ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 35 (2019-09-15), Heft 18, S. 3421-3432
    Online academicJournal
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    Integrative construction of regulatory region networks in 127 human reference epigenomes by matrix factorization.
    Liu, D ; Davila-Velderrain, J ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 47 (2019-08-22), Heft 14, S. 7235-7246
    Online academicJournal
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  19. Detailansicht für Treffer 19 öffnen
    DCI: learning causal differences between gene regulatory networks.
    Belyaeva, A ; Squires, C ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 37 (2021-09-29), Heft 18, S. 3067-3069
    Online academicJournal
    Zugriff:
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    Controlling large Boolean networks with single-step perturbations.
    Baudin, A ; Paul, S ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 35 (2019-07-15), Heft 14, S. i558-i567
    Online academicJournal
    Zugriff:
    Full Text Finder (Volltext)
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