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    Pan-cancer experimental characteristic of human transcriptional patterns connected with telomerase reverse transcriptase (TERT) gene expression status.
    Drobyshev, Aleksey ; Modestov, Alexander ; et al.
    In: Frontiers in Genetics, 2024-06-10, S. 1-22
    Online academicJournal
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    Long non‐coding RNAs mediate fish gene expression in response to ocean acidification.
    Kang, Jingliang ; Chung, Arthur ; et al.
    In: Evolutionary Applications, Jg. 17 (2024-02-01), Heft 2, S. 1-14
    Online academicJournal
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    Transcriptional response of the heart to vagus nerve stimulation.
    Kellett, Daniel O. ; Aziz, Qadeer ; et al.
    In: Physiological Genomics, Jg. 56 (2024-02-01), Heft 2, S. 167-178
    academicJournal
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    SeedMatchR: identify off-target effects mediated by siRNA seed regions in RNA-seq experiments.
    Cazares, Tareian ; Higgs, Richard E ; et al.
    In: Bioinformatics, Jg. 40 (2024), Heft 1, S. 1-4
    Online academicJournal
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    Quantifying 3′UTR length from scRNA-seq data reveals changes independent of gene expression.
    Fansler, Mervin M. ; Mitschka, Sibylle ; et al.
    In: Nature Communications, Jg. 15 (2024-05-14), Heft 1, S. 1-18
    Online academicJournal
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    Premature ovarian insufficiency is associated with global alterations in the regulatory landscape and gene expression in balanced X-autosome translocations.
    Di-Battista, Adriana ; Favilla, Bianca Pereira ; et al.
    In: Epigenetics & Chromatin, Jg. 16 (2023-05-19), Heft 1, S. 1-10
    Online academicJournal
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    GRNRI: Gene Regulatory Network Inference using Unsupervised Graph Neural Network.
    Abdulhameed, Fatema ; Abbas, Hazem ; et al.
    In: International Journal of Computing & Digital Systems, Jg. 15 (2024-02-01), Heft 1, S. 115-125
    academicJournal
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    miR-665-Mediated Regulation of AHCYL2 and BVES Genes in Recurrent Implantation Failure.
    Cho, Sung Hwan ; Kim, Young Myeong ; et al.
    In: Genes, Jg. 15 (2024-02-01), Heft 2, S. 244-260
    Online academicJournal
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    Single-cell allele-specific expression analysis reveals dynamic and cell-type-specific regulatory effects.
    Qi, Guanghao ; Strober, Benjamin J. ; et al.
    In: Nature Communications, Jg. 14 (2023-10-09), Heft 1, S. 1-14
    Online academicJournal
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    Gene regulation analysis of patient-derived iPSCs and its CRISPR-corrected control provides a new tool for studying perturbations of ELMOD3 c.512A>G mutation during the development of inherited hearing loss.
    Liu, Xianlin ; Wen, Jie ; et al.
    In: PLoS ONE, Jg. 18 (2023-09-14), Heft 9, S. 1-18
    Online academicJournal
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    Transcriptional regulators ensuring specific gene expression and decision making at high TGFb doses.
    In: Genomics & Genetics Weekly, 2024-05-17, S. 1961-1961
    serialPeriodical
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    Pro-inflammatory polarization and colorectal cancer modulate alternative and intronic polyadenylation in primary human macrophages.
    Wilton, Joana ; Lopes de Mendonça, Filipa ; et al.
    In: Frontiers in Immunology, 2023-06-22, S. 1-19
    Online academicJournal
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    TF-Prioritizer: a Java pipeline to prioritize condition-specific transcription factors.
    Hoffmann, Markus ; Trummer, Nico ; et al.
    In: GigaScience, Jg. 12 (2023), Heft 1, S. 1-15
    Online academicJournal
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    CellRegMap: a statistical framework for mapping context‐specific regulatory variants using scRNA‐seq.
    Cuomo, Anna S E ; Heinen, Tobias ; et al.
    In: Molecular Systems Biology, Jg. 18 (2022-08-01), Heft 8, S. 1-14
    Online academicJournal
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    Error modelled gene expression analysis (EMOGEA) provides a superior overview of time course RNA-seq measurements and low count gene expression.
    Barra, Jasmine ; Taverna, Federico ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 25 (2024-05-01), Heft 3, S. 1-12
    academicJournal
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    Integrating pathway knowledge with deep neural networks to reduce the dimensionality in single-cell RNA-seq data.
    Gundogdu, Pelin ; Loucera, Carlos ; et al.
    In: BioData Mining, Jg. 15 (2022-01-03), Heft 1, S. 1-21
    Online academicJournal
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    Analysis of the Trypanosoma brucei EATRO 164 Bloodstream Guide RNA Transcriptome.
    Kirby, Laura E. ; Sun, Yanni ; et al.
    In: PLoS Neglected Tropical Diseases, Jg. 10 (2016-07-11), Heft 7, S. 1-18
    Online academicJournal
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    intePareto: an R package for integrative analyses of RNA-Seq and ChIP-Seq data.
    Cao, Yingying ; Kitanovski, Simo ; et al.
    In: BMC Genomics, Jg. 21 (2020-12-29), S. 1-9
    Online academicJournal
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    GeneTEFlow: A Nextflow-based pipeline for analysing gene and transposable elements expression from RNA-Seq data.
    Liu, Xiaochuan ; Bienkowska, Jadwiga R. ; et al.
    In: PLoS ONE, Jg. 15 (2020-08-31), Heft 8, S. 1-8
    Online academicJournal
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    Analysis of intronic and exonic reads in RNA-seq data characterizes transcriptional and post-transcriptional regulation.
    Gaidatzis, Dimos ; Burger, Lukas ; et al.
    In: Nature Biotechnology, Jg. 33 (2015-07-01), Heft 7, S. 722-729
    academicJournal
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