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  1. Detailansicht für Treffer 1 öffnen
    iDESC: identifying differential expression in single-cell RNA sequencing data with multiple subjects.
    Liu, Yunqing ; Zhao, Jiayi ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 24 (2023-08-22), Heft 1, S. 1-20
    Online academicJournal
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    RNA-clique: a method for computing genetic distances from RNA-seq data.
    Tapia, Andrew C. ; Jaromczyk, Jerzy W. ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-04), Heft 1, S. 1-33
    Online academicJournal
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    A comparison of RNA-Seq data preprocessing pipelines for transcriptomic predictions across independent studies.
    Van, Richard ; Alvarez, Daniel ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-05-08), Heft 1, S. 1-22
    Online academicJournal
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    Curare and GenExVis: a versatile toolkit for analyzing and visualizing RNA-Seq data.
    Blumenkamp, Patrick ; Pfister, Max ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-29), Heft 1, S. 1-12
    Online academicJournal
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    Feature-specific quantile normalization and feature-specific mean–variance normalization deliver robust bi-directional classification and feature selection performance between microarray and RNAseq data.
    Skubleny, Daniel ; Ghosh, Sunita ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-29), Heft 1, S. 1-14
    Online academicJournal
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    Machine learning on alignment features for parent-of-origin classification of simulated hybrid RNA-seq.
    Miller, Jason R. ; Adjeroh, Donald A.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-12), Heft 1, S. 1-21
    Online academicJournal
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    A clustering procedure for three-way RNA sequencing data using data transformations and matrix-variate Gaussian mixture models.
    Scharl, Theresa ; Grün, Bettina
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-01), Heft 1, S. 1-21
    Online academicJournal
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    Cellograph: a semi-supervised approach to analyzing multi-condition single-cell RNA-sequencing data using graph neural networks.
    Shahir, Jamshaid A. ; Stanley, Natalie ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-01-15), Heft 1, S. 1-19
    Online academicJournal
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    ScLSTM: single-cell type detection by siamese recurrent network and hierarchical clustering.
    Jiang, Hanjing ; Huang, Yabing ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 24 (2023-11-07), Heft 1, S. 1-15
    Online academicJournal
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    Fast and sensitive validation of fusion transcripts in whole-genome sequencing data.
    Hafstað, Völundur ; Häkkinen, Jari ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 24 (2023-09-23), Heft 1, S. 1-14
    Online academicJournal
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    ROGUE: an R Shiny app for RNA sequencing analysis and biomarker discovery.
    Farrel, Alvin ; Li, Peng ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 24 (2023-07-29), Heft 1, S. 1-13
    Online academicJournal
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  12. Detailansicht für Treffer 12 öffnen
    Exploring the transcriptome of non-model oleaginous microalga Dunaliella tertiolecta through high-throughput sequencing and high performance computing.
    Yao, Lina ; Kenneth Wei Min Tan ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 18 (2017-02-22), S. 1-11
    Online academicJournal
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    Boolean implication analysis of single-cell data predicts retinal cell type markers.
    Subramanian, Rohan ; Sahoo, Debashis
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 23 (2022-09-16), Heft 1, S. 1-18
    Online academicJournal
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    GEMmaker: process massive RNA-seq datasets on heterogeneous computational infrastructure.
    Hadish, John A. ; Biggs, Tyler D. ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 23 (2022-05-02), Heft 1, S. 1-11
    Online academicJournal
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    A fuzzy method for RNA-Seq differential expression analysis in presence of multireads.
    Consiglio, Arianna ; Mencar, Corrado ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 17 (2016-11-07), S. 167-182
    Online academicJournal
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    NBLDA: negative binomial linear discriminant analysis for RNA-Seq data.
    Dong, Kai ; Zhao, Hongyu ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 17 (2016-09-13), S. 1-10
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    CellTree: an R/bioconductor package to infer the hierarchical structure of cell populations from single-cell RNA-seq data.
    duVerle, David A. ; Yotsukura, Sohiya ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 17 (2016-09-13), S. 1-17
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    Statistical inference for time course RNA-Seq data using a negative binomial mixed-effect model.
    Sun, Xiaoxiao ; Dalpiaz, David ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 17 (2016-08-26), S. 1-13
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    multiDE: a dimension reduced model based statistical method for differential expression analysis using RNA-sequencing data with multiple treatment conditions.
    Kang, Guangliang ; Du, Li ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 17 (2016-06-22), S. 1-16
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    Discrete distributional differential expression (D³E) - a tool for gene expression analysis of single-cell RNA-seq data.
    Delmans, Mihails ; Hemberg, Martin
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 17 (2016-02-29), S. 1-13
    Online academicJournal
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