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    Transcriptomic studies revealed pathophysiological impact of COVID-19 to predominant health conditions.
    Nain, Zulkar ; Barman, Shital K ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 22 (2021-11-01), Heft 6, S. 1-15
    Online academicJournal
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    Data-driven selection of analysis decisions in single-cell RNA-seq trajectory inference.
    Dong, Xiaoru ; Leary, Jack R ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 25 (2024-05-01), Heft 3, S. 1-12
    academicJournal
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    Exploring miRNA–target gene pair detection in disease with coRmiT.
    Cordoba-Caballero, Jose ; Perkins, James R ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-01), Heft 2, S. 1-13
    academicJournal
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    CAP-RNAseq: an integrated pipeline for functional annotation and prioritization of co-expression clusters.
    Vural-Ozdeniz, Merve ; Calisir, Kubra ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 25 (2024-03-01), Heft 2, S. 1-16
    academicJournal
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    A multi-Poisson dynamic mixture model to cluster developmental patterns of gene expression by RNA-seq.
    Ye, Meixia ; Wang, Zhong ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 16 (2015-03-01), Heft 2, S. 205-215
    Online academicJournal
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    hppRNA—a Snakemake-based handy parameter-free pipeline for RNA-Seq analysis of numerous samples.
    Wang, Dapeng
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 19 (2018-07-01), Heft 4, S. 622-626
    Online academicJournal
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    Comparative evaluation of isoform-level gene expression estimation algorithms for RNA-seq and exon-array platforms.
    Dapas, Matthew ; Kandpal, Manoj ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 18 (2017-03-01), Heft 2, S. 260-269
    Online academicJournal
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    A comprehensive assessment of cell type-specific differential expression methods in bulk data.
    Meng, Guanqun ; Tang, Wen ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023), Heft 1, S. 1-13
    Online academicJournal
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    MTD: a unique pipeline for host and meta-transcriptome joint and integrative analyses of RNA-seq data.
    Wu, Fei ; Liu, Yao-Zhong ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 23 (2022-05-01), Heft 3, S. 1-11
    Online academicJournal
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    Bibliometric review of ATAC-Seq and its application in gene expression.
    Luo, Liheng ; Gribskov, Michael ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 23 (2022-05-01), Heft 3, S. 1-13
    Online academicJournal
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    A bi-Poisson model for clustering gene expression profiles by RNA-seq.
    Wang, Ningtao ; Wang, Yaqun ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 15 (2014-07-01), Heft 4, S. 534-541
    Online academicJournal
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  12. Detailansicht für Treffer 12 öffnen
    Anti-bias training for (sc)RNA-seq: experimental and computational approaches to improve precision.
    Davies, Philip ; Jones, Matt ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 22 (2021-11-01), Heft 6, S. 1-15
    Online academicJournal
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    Integrative, normalization-insusceptible statistical analysis of RNA-Seq data, with improved differential expression and unbiased downstream functional analysis.
    Fanidis, Dionysios ; Moulos, Panagiotis
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 22 (2021-05-01), Heft 3, S. 1-15
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    CCLA: an accurate method and web server for cancer cell line authentication using gene expression profiles.
    Zhang, Qiong ; Luo, Mei ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 22 (2021-05-01), Heft 3, S. 1-9
    Online academicJournal
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    Homoeologous gene expression and co-expression network analyses and evolutionary inference in allopolyploids.
    Hu, Guanjing ; Grover, Corrinne E ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 22 (2021-03-01), Heft 2, S. 1819-1835
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  16. Detailansicht für Treffer 16 öffnen
    TOD-CUP: a gene expression rank-based majority vote algorithm for tissue origin diagnosis of cancers of unknown primary.
    Shen, Yifei ; Chu, Qinjie ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 22 (2021-03-01), Heft 2, S. 2106-2118
    Online academicJournal
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  17. Detailansicht für Treffer 17 öffnen
    Toward a gold standard for benchmarking gene set enrichment analysis.
    Geistlinger, Ludwig ; Csaba, Gergely ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 22 (2021), Heft 1, S. 545-556
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    Quantile regression for challenging cases of eQTL mapping.
    Sun, Bo ; Chen, Liang
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 21 (2020-09-01), Heft 5, S. 1756-1765
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    HiFreSP: A novel high-frequency sub-pathway mining approach to identify robust prognostic gene signatures.
    Li, Meng ; Zhao, Jianmei ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 21 (2020-07-01), Heft 4, S. 1411-1424
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    SEGtool: a specifically expressed gene detection tool and applications in human tissue and single-cell sequencing data.
    Zhang, Qiong ; Liu, Wei ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 19 (2018-11-01), Heft 6, S. 1325-1336
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