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    Parameter estimation and forecasting with quantified uncertainty for ordinary differential equation models using QuantDiffForecast: A MATLAB toolbox and tutorial.
    Chowell, G ; Bleichrodt, A ; et al.
    In: Statistics in medicine, Jg. 43 (2024-04-30), Heft 9, S. 1826-1848
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    Simultaneous application of enzyme and thermodynamic constraints to metabolic models using an updated Python implementation of GECKO.
    Carrasco Muriel, J ; Long, C ; et al.
    In: Microbiology spectrum, Jg. 11 (2023-12-12), Heft 6, S. e0170523
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    Tutorial on model selection and validation of model input into precision dosing software for model-informed precision dosing.
    Taylor, ZL ; Poweleit, EA ; et al.
    In: CPT: pharmacometrics & systems pharmacology, Jg. 12 (2023-12-01), Heft 12, S. 1827-1845
    Online academicJournal
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    In-depth analysis of patterns in selection of different physiologically-based pharmacokinetic modeling tools: Part II - Assessment of model reusability and comparison between open and non-open source-code software.
    Aldibani, HKA ; Rajput, AJ ; et al.
    In: Biopharmaceutics & drug disposition, Jg. 44 (2023-08-01), Heft 4, S. 292-300
    Online academicJournal
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    In-depth analysis of patterns in selection of different physiologically based pharmacokinetic modeling tools: Part I - Applications and rationale behind the use of open source-code software.
    Rajput, AJ ; Aldibani, HKA ; et al.
    In: Biopharmaceutics & drug disposition, Jg. 44 (2023-06-01), Heft 3, S. 274-285
    Online academicJournal
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    Biological dispersion in the time domain using finite element method software.
    Guedert, R ; Andrade, DLLS ; et al.
    In: Scientific reports, Jg. 13 (2023-12-18), Heft 1, S. 22868
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    In silico prediction of bioequivalence of atorvastatin tablets based on GastroPlus™ software.
    Wang, L ; Chen, J ; et al.
    In: BMC pharmacology & toxicology, Jg. 24 (2023-11-28), Heft 1, S. 69
    Online academicJournal
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    Evaluation of Free Online ADMET Tools for Academic or Small Biotech Environments.
    Dulsat, J ; López-Nieto, B ; et al.
    In: Molecules (Basel, Switzerland), Jg. 28 (2023-01-12), Heft 2
    Online academicJournal
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    Predicting the correct dose in children: Role of computational Pediatric Physiological-based pharmacokinetics modeling tools.
    Zhou, X ; Dun, J ; et al.
    In: CPT: pharmacometrics & systems pharmacology, Jg. 12 (2023), Heft 1, S. 13-26
    Online academicJournal
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    Balancing biomass reaction stoichiometry and measured fluxes in flux balance analysis.
    von Kamp A ; Klamt, S
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023-10-03), Heft 10
    Online academicJournal
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    Guide to development of compound files for PBPK modeling in the Simcyp population-based simulator.
    Ezuruike, U ; Zhang, M ; et al.
    In: CPT: pharmacometrics & systems pharmacology, Jg. 11 (2022-07-01), Heft 7, S. 805-821
    Online academicJournal
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    Directional propagation of action potential within a single cell and intercellular conduction within a cell aggregate using model cell systems.
    Morishita, R ; Sowa, K ; et al.
    In: Analytical sciences : the international journal of the Japan Society for Analytical Chemistry, Jg. 39 (2023-06-01), Heft 6, S. 945-955
    Online academicJournal
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    Integrative Gene Expression and Metabolic Analysis Tool IgemRNA .
    Grausa, K ; Mozga, I ; et al.
    In: Biomolecules, Jg. 12 (2022-04-16), Heft 4
    Online academicJournal
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    PBPK Modeling to Simulate the Fate of Compounds in Living Organisms.
    Bois, FY ; Tebby, C ; et al.
    In: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), Jg. 2425 (2022), S. 29-56
    academicJournal
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    GPRuler: Metabolic gene-protein-reaction rules automatic reconstruction.
    Di Filippo, M ; Damiani, C ; et al.
    In: PLoS computational biology, Jg. 17 (2021-11-08), Heft 11, S. e1009550
    Online academicJournal
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    A study of a diauxic growth experiment using an expanded dynamic flux balance framework.
    Karlsen, E ; Gylseth, M ; et al.
    In: PloS one, Jg. 18 (2023-01-06), Heft 1, S. e0280077
    Online academicJournal
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    Symbolic kinetic models in python (SKiMpy): intuitive modeling of large-scale biological kinetic models.
    Weilandt, DR ; Salvy, P ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 39 (2023), Heft 1
    Online academicJournal
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    Creation and analysis of biochemical constraint-based models using the COBRA Toolbox v.3.0.
    Heirendt, L ; Arreckx, S ; et al.
    In: Nature protocols, Jg. 14 (2019-03-01), Heft 3, S. 639-702
    academicJournal
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    mstree: A Multispecies Coalescent Approach for Estimating Ancestral Population Size and Divergence Time during Speciation with Gene Flow.
    Liu, J ; Liu, Q ; et al.
    In: Genome biology and evolution, Jg. 12 (2020-05-01), Heft 5, S. 715-719
    Online report
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    The status of causality in biological databases: data resources and data retrieval possibilities to support logical modeling.
    Touré, V ; Flobak, Å ; et al.
    In: Briefings in bioinformatics, Jg. 22 (2021-07-20), Heft 4
    Online academicJournal
    Zugriff:
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