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    Alignment and quantification of ChIP-exo crosslinking patterns reveal the spatial organization of protein-DNA complexes.
    Yamada, N ; Rossi, MJ ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 48 (2020-11-18), Heft 20, S. 11215-11226
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    ConBind: motif-aware cross-species alignment for the identification of functional transcription factor binding sites.
    Lelieveld, SH ; Schütte, J ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 44 (2016-05-05), Heft 8, S. e72
    Online academicJournal
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    STAMP: a web tool for exploring DNA-binding motif similarities.
    Mahony, S ; Benos, PV
    In: Nucleic acids research, Jg. 35 (2007-07-01), Heft Web Server issue, S. W253-8
    Online academicJournal
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    The twilight zone of cis element alignments.
    Sebastian, A ; Contreras-Moreira, B
    In: Nucleic acids research, Jg. 41 (2013-02-01), Heft 3, S. 1438-49
    Online academicJournal
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    ReLA, a local alignment search tool for the identification of distal and proximal gene regulatory regions and their conserved transcription factor binding sites.
    González, S ; Montserrat-Sentís, B ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 28 (2012-03-15), Heft 6, S. 763-70
    Online academicJournal
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    SCOPE: a web server for practical de novo motif discovery.
    Carlson, JM ; Chakravarty, A ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 35 (2007-07-01), Heft Web Server issue, S. W259-64
    Online academicJournal
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    Computer-assisted prediction, classification, and delimitation of protein binding sites in nucleic acids.
    Frech, K ; Herrmann, G ; et al.
    In: Nucleic acids research, Jg. 21 (1993-04-11), Heft 7, S. 1655-64
    Online academicJournal
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    Inferring protein-DNA dependencies using motif alignments and mutual information.
    Mahony, S ; Auron, PE ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 23 (2007-07-01), Heft 13, S. i297-304
    Online academicJournal
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    A sequential Monte Carlo EM approach to the transcription factor binding site identification problem.
    Jackson, ES ; Fitzgerald, WJ
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 23 (2007-06-01), Heft 11, S. 1313-20
    Online academicJournal
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    ClusterDraw web server: a tool to identify and visualize clusters of binding motifs for transcription factors.
    Papatsenko, D
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 23 (2007-04-15), Heft 8, S. 1032-4
    Online academicJournal
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    SPACER: identification of cis-regulatory elements with non-contiguous critical residues.
    Chakravarty, A ; Carlson, JM ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 23 (2007-04-15), Heft 8, S. 1029-31
    Online academicJournal
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  12. Detailansicht für Treffer 12 öffnen
    Simultaneous alignment and annotation of cis-regulatory regions.
    Bais, AS ; Grossmann, S ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 23 (2007-01-15), Heft 2, S. e44-9
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    MUSA: a parameter free algorithm for the identification of biologically significant motifs.
    Mendes, ND ; Casimiro, AC ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 22 (2006-12-15), Heft 24, S. 2996-3002
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    Adding sequence context to a Markov background model improves the identification of regulatory elements.
    Kim, NK ; Tharakaraman, K ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 22 (2006-12-01), Heft 23, S. 2870-5
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    Identifying cis-regulatory modules by combining comparative and compositional analysis of DNA.
    Pierstorff, N ; Bergman, CM ; et al.
    In: Bioinformatics (Oxford, England), Jg. 22 (2006-12-01), Heft 23, S. 2858-64
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