Investigation of circulating infectious agents in experimental Beagle dogs of a production colony and three research facilities in China from June 2021 to May 2022.

To understand the epizootiologic characteristics of pathogens and opportunistic infections in one Beagle dog production colony and three research facilities, viruses and mycoplasma were detected in 1777 samples collected from Beagle dogs in China by polymerase chain reaction/reverse transcription polymerase chain reaction, and bacteria were isolated and identified by 16S rRNA sequence analysis. In addition, genotyping of the major circulating viruses was carried out by amplification of gene fragments and homology analysis. Canine coronavirus (CCoV), Escherichia coli, canine parvovirus (CPV), Bordetella bronchiseptica, Clostridium perfringens, Mycoplasma cynos, Klebsiella pneumoniae, Streptococcus canis, canine astrovirus (CaAstV), canine kobuvirus (CaKV), Pseudomonas aeruginosa, Proteus mirabilis, Macrococcus canis, Pasteurella canis, canine bocavirus (CBoV) and canine adenovirus (CAdV) were detected in the samples. Single, double, triple and quadruple infections accounted for 6.6%, 1.4%, 1.2% and 0.96% of samples, respectively. CCoV strains in 81 samples included three genotypes, CCoV-I, CCoV-IIa and CCoV-IIb, by analysis of S gene. The rate of single infection of CCoV-I, CCoV-IIa or CCoV-IIb was 19%, 38% or 7.4% respectively. The double and triple infection rates of CCoV were 32.8% and 2.5% respectively. All CPV strains in 36 samples belonged to CPV-2c. There were three amino acid differences in the Fiber protein of CAdV-positive sample QD2022, compared with the reference strain Toronto A26/61 and the vaccine strain YCA-18. These results suggest that CCoV and CPV are primary infectious agents, and that these two viruses were often identified in mixed infections, or coinfections alongside mycoplasma or other bacteria. These results will provide the basis for improvements in prevention and control of naturally occurring infectious diseases in Beagle dog production colonies and research facilities. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Para comprender las características epizootiológicas de los patógenos y las infecciones oportunistas en una colonia de producción de perros beagle y tres instalaciones de investigación, se detectaron virus y micoplasmas en 1777 muestras recogidas de perros beagle en China mediante PCR/RT-PCR y se aislaron bacterias que se identificaron mediante el análisis de la secuencia del ARNr 16S. Asimismo, se realizó el genotipado de los principales virus circulantes mediante amplificación de fragmentos de genes y análisis de homología. Se detectaron CCoV, E. coli, CPV, Bb, Clostridium perfringens, M.cynos, K. pneumoniae, S. canis, CaAstV, CaKV, Pseudomonas aeruginosa, Proteus mirabilis, Macrococcus canis, Pasteurella canis, CBoV y CAdV en las muestras. Las infecciones simples, dobles, triples y cuádruples representaron el 6,6%, 1,4%, 1,2% y 0,96% de las muestras, respectivamente. Las cepas de CCoV en 81 muestras incluían tres genotipos CCoV-I, CCoV-IIa y CCoV-IIb por análisis del gen S. La tasa de infección única de CCoV-I, CCoV-IIa o CCoV-IIb fue del 19%, 38% o 7,4% respectivamente. Las tasas de infección doble y triple de CCoV fueron del 32,8% y el 2,5% respectivamente. Todas las cepas de CPV en 36 muestras pertenecían a CPV-2c. Había tres diferencias de aminoácidos en la proteína Fiber de la muestra positiva de CAdV QD2022, en comparación con la cepa de referencia Toronto A26/61 y la cepa vacunal YCA-18. Estos resultados indican que el CCoV y el CPV son agentes infecciosos primarios, y que estos dos virus se identificaron a menudo en infecciones mixtas, o coinfecciones junto a micoplasmas u otras bacterias. Además, los resultados proporcionarán la base para mejorar la prevención y el control de las enfermedades infecciosas que se producen de forma natural en las colonias de producción de perros beagle y en las instalaciones de investigación. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Afin de comprendre les caractéristiques épizootiologiques des pathogènes et des infections opportunistes dans une colonie de production de beagles et dans trois installations de recherche, des virus et des mycoplasmes ont été détectés dans 1777 échantillons prélevés sur des beagles en Chine par PCR/RT-PCR, et des bactéries ont été isolées et identifiées par analyse de séquence d'ARNr 16S. De plus, le génotypage des principaux virus circulants a été réalisé par amplification de fragments de gènes et analyse d'homologie. Les échantillons ont révélé la présence de CCoV, E. coli, CPV, BB, Clostridium perfringens, M.cynos, K. pneumoniae, S. canis, CaAstV, CaKV, Pseudomonas aeruginosa, Proteus mirabilis, Macrococcus canis, Pasteurella canis, CBoV et CAdV. Les infections simples, doubles, triples et quadruples concernaient respectivement 6,6%, 1,4%, 1,2% et 0,96% des échantillons. Les souches de CCoV de 81 échantillons comprenaient trois génotypes CCoV-I, CCoV-IIa et CCoV-IIb par analyse du gène S, le taux d'infection unique par CCoV-I, CCoV-IIa ou CCoV-IIb était respectivement de 19%, 38% ou 7,4%. Les taux d'infection double et triple au CCoV étaient respectivement de 32,8% et 2,5%. Toutes les souches de CPV dans 36 échantillons appartenaient au CPV-2c. Trois différences ont été observées entre les acides aminés de la protéine fibreuse de l'échantillon QD2022 positif au CAdV, comparativement à la souche de référence Toronto A26/61 et à la souche vaccinale YCA-18. Ces résultats suggèrent que le CCoV et le CPV sont des agents infectieux primaires, et que ces deux virus ont souvent été identifiés dans des infections mixtes, ou des co-infections aux côtés de mycoplasmes ou d'autres bactéries. Ces résultats serviront de base à l'amélioration de la prévention et du contrôle des maladies infectieuses naturelles dans les colonies de production de beagles et les installations de recherche. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Zur Untersuchung der epizootiologischen Merkmale von Krankheitserregern und opportunistischen Infektionen in einer Beagle-Hund-Zuchtkolonie und drei Forschungseinrichtungen wurden in 1777 Proben, die von Beagle-Hunden in China entnommen wurden, mittels PCR/RT-PCR Viren und Mykoplasmen nachgewiesen und Bakterien isoliert und durch 16S rRNA-Sequenzanalyse identifiziert. Darüber hinaus wurde eine Genotypisierung der wichtigsten zirkulierenden Viren durch Amplifikation von Genfragmenten und Homologieanalyse durchgeführt. In den Proben wurden CCoV, E. coli, CPV, Bb, Clostridium perfringens, M. cynos, K. pneumoniae, S. canis, CaAstV, CaKV, Pseudomonas aeruginosa, Proteus mirabilis, Macrococcus canis, Pasteurella canis, CBoV und CAdV nachgewiesen. Einzel-, Doppel-, Dreifach- und Vierfachinfektionen machten 6,6%, 1,4%, 1,2% bzw. 0,96% der Proben aus. Die CCoV-Stämme in 81 Proben umfassten die drei Genotypen CCoV-I, CCoV-IIa und CCoV-IIb durch Analyse des S-Gens. Die Rate der Einfachinfektionen mit CCoV-I, CCoV-IIa oder CCoV-IIb betrug 19%, 38% bzw. 7,4%. Die Doppel- und Dreifachinfektionsraten von CCoV betrugen 32,8% bzw. 2,5%. Alle CPV-Stämme in 36 Proben gehörten zu CPV-2c. Das Faserprotein der CAdV-positiven Probe QD2022 wies drei Aminosäureunterschiede gegenüber dem Referenzstamm Toronto A26/61 und dem Vakzinstamm YCA-18 auf. Diese Ergebnisse deuten darauf hin, dass CCoV und CPV primäre Infektionserreger sind, und dass diese beiden Viren häufig bei Mischinfektionen oder Koinfektionen mit Mykoplasmen oder anderen Bakterien nachgewiesen wurden. Diese Ergebnisse werden die Grundlage für Verbesserungen bei der Vorbeugung und Kontrolle natürlich auftretender Infektionskrankheiten in Beagle-Hund-Zuchtkolonien und -Forschungseinrichtungen bilden. [ABSTRACT FROM AUTHOR]