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Pseudouridine is an abundant mRNA modification found in diverse organisms ranging from bacteria and viruses to multicellular plants and humans. New developments in pseudouridine profiling provide quantitative tools to map mRNA pseudouridylation sites. Sparse biochemical studies establish the potential for mRNA pseudouridylation to affect most stages of the mRNA life cycle from birth to death. This recent progress sets the stage for deeper investigations into the molecular and cellular functions of specific mRNA pseudouridines, including in disease.

Titel:	Recent developments, opportunities, and challenges in the study of mRNA pseudouridylation.
Autor/in / Beteiligte Person:	Gilbert, WV
Zeitschrift:	RNA (New York, N.Y.), Jg. 30 (2024-04-16), Heft 5, S. 530-536
Veröffentlichung:	<2003->: Cold Spring Harbor, NY : Cold Spring Harbor Laboratory Press ; <i>Original Publication</i>: New York, NY : Cambridge University Press, c1995-, 2024
Medientyp:	academicJournal
ISSN:	1469-9001 (electronic)
DOI:	10.1261/rna.079975.124
Schlagwort:	Intramolecular Transferases metabolism Transcription, Genetic RNA Precursors chemistry RNA Precursors metabolism RNA-Binding Proteins metabolism Protein Biosynthesis Protein Binding Humans Animals RNA, Messenger chemistry RNA, Messenger metabolism Research trends
Sonstiges:	Nachgewiesen in: MEDLINE Sprachen: English Publication Type: Journal Article; Review Language: English [RNA] 2024 Apr 16; Vol. 30 (5), pp. 530-536. <i>Date of Electronic Publication: </i>2024 Apr 16. MeSH Terms: RNA, Messenger* / chemistry ; RNA, Messenger* / metabolism ; Research* / trends ; Intramolecular Transferases / metabolism ; Transcription, Genetic ; RNA Precursors / chemistry ; RNA Precursors / metabolism ; RNA-Binding Proteins / metabolism ; Protein Biosynthesis ; Protein Binding ; Humans ; Animals References: Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Nov 12;116(46):23068-23074. (PMID: 31672910) ; Cell. 2014 Sep 25;159(1):148-162. (PMID: 25219674) ; Annu Rev Biochem. 2023 Jun 20;92:175-198. (PMID: 37018844) ; Nat Chem Biol. 2023 Oct;19(10):1185-1195. (PMID: 36997645) ; RNA. 2017 May;23(5):611-618. (PMID: 28138061) ; Nat Chem Biol. 2015 Aug;11(8):592-7. (PMID: 26075521) ; Nat Chem Biol. 2021 Nov;17(11):1178-1187. (PMID: 34556860) ; J Biol Chem. 2017 Mar 10;292(10):4350-4357. (PMID: 28130447) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Apr 2;116(14):6784-6789. (PMID: 30872485) ; Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Mar 24;112(12):3841-6. (PMID: 25755260) ; Nature. 2014 Nov 6;515(7525):143-6. (PMID: 25192136) ; Nat Biotechnol. 2023 Mar;41(3):355-366. (PMID: 36302990) ; Nat Biotechnol. 2021 Oct;39(10):1278-1291. (PMID: 33986546) ; Nat Chem Biol. 2019 Oct;15(10):966-974. (PMID: 31477916) ; Nat Methods. 2015 Aug;12(8):767-72. (PMID: 26121403) ; Mol Cell. 2022 Feb 3;82(3):645-659.e9. (PMID: 35051350) ; Biophys Chem. 2022 Jun;285:106780. (PMID: 35313212) ; Nat Biotechnol. 2013 May;31(5):458-64. (PMID: 23604283) ; Cell. 2013 Dec 5;155(6):1409-21. (PMID: 24269006) ; Cell. 2019 Jul 25;178(3):731-747.e16. (PMID: 31257032) ; Genes (Basel). 2019 Jan 25;10(2):. (PMID: 30691071) ; PLoS One. 2014 Oct 29;9(10):e110799. (PMID: 25353621) ; Nat Biotechnol. 2023 Mar;41(3):344-354. (PMID: 36302989) ; Annu Rev Genet. 2020 Nov 23;54:309-336. (PMID: 32870730) ; Nucleic Acids Res. 2016 Jan 29;44(2):852-62. (PMID: 26578598) ; PLoS Biol. 2022 May 24;20(5):e3001622. (PMID: 35609439) ; Mol Cell. 2022 Jan 20;82(2):404-419.e9. (PMID: 34798057) ; Science. 2023 Feb 17;379(6633):677-682. (PMID: 36705538) ; Cell Rep. 2022 Aug 30;40(9):111300. (PMID: 35988540) ; Genome Biol. 2022 May 16;23(1):115. (PMID: 35578346) ; Mol Cell. 2023 Jan 19;83(2):237-251.e7. (PMID: 36599352) ; Genome Res. 2017 Aug;27(8):1460. (PMID: 28765290) ; J Am Chem Soc. 2019 Oct 16;141(41):16450-16460. (PMID: 31538776) ; Mol Cell. 2023 Feb 16;83(4):637-651.e9. (PMID: 36764303) ; Mol Cell Biol. 2010 Sep;30(17):4108-19. (PMID: 20606010) ; RNA. 2021 Apr;27(4):527-541. (PMID: 33376190) ; Mol Cell. 2023 Jan 5;83(1):139-155.e9. (PMID: 36521489) ; Nat Commun. 2023 Jan 19;14(1):334. (PMID: 36658122) ; Mol Cell. 2019 Aug 8;75(3):427-441.e5. (PMID: 31353208) ; Genome Biol. 2021 Dec 6;22(1):330. (PMID: 34872593) Grant Information: R01 GM101316 United States GM NIGMS NIH HHS Contributed Indexing: Keywords: mRNA modification; pseudouridine Substance Nomenclature: 0 (RNA, Messenger) ; EC 5.4.99.- (pseudouridine synthases) ; EC 5.4.- (Intramolecular Transferases) ; 0 (RNA Precursors) ; 0 (RNA-Binding Proteins) Entry Date(s): Date Created: 20240326 Date Completed: 20240418 Latest Revision: 20240502 Update Code: 20240502 PubMed Central ID: PMC11019745

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Recent developments, opportunities, and challenges in the study of mRNA pseudouridylation.